海外前沿资讯：2024-4-16（1）

背景

胃癌（GC）是全球范围内高发且预后较差的恶性肿瘤之一，其早期诊断率较低，很大程度上归因于缺乏具有临床诊断价值的血清生物标志物。跨组学分析作为一种强大的策略，能够整合多层面的数据资源，有助于揭示癌症潜在生物标志物。本研究旨在通过整合蛋白质组学与转录组学数据集，筛选并验证胃癌诊断的血清生物标志物。

患者痛点

胃癌患者在诊疗过程中面临的主要痛点在于，目前尚无简便、灵敏且特异的血清生物标志物用于早期筛查与诊断，导致许多病例在发现时已进入中晚期，治疗难度增大，生存率降低。同时，针对胃癌的有效治疗靶点也相对有限，亟待发掘新的治疗策略以改善患者预后。

研究方案

1. 跨组学分析：研究人员首先将前期基于适配体技术的胃癌血清蛋白质组学数据集，与癌症基因组图谱（TCGA）数据库中的胃癌组织RNA测序数据集进行交叉分析，识别两组数据中共有的差异表达基因（DEGs）。

2. 候选生物标志物筛选：运用LASSO回归和随机森林分析方法，从上述共有的DEGs中挑选出关键候选生物标志物。随后，在原始数据集及独立验证数据集中（Gene Expression Omnibus, GEO），分析这些候选标志物的mRNA水平及其对胃癌的诊断性能。

3. 生物信息学评估：对筛选出的价值较高的候选生物标志物进行生物信息学分析，以确定哪些与胃癌的生物学行为密切相关，有望成为潜在的诊断标志物。

4. 临床验证与细胞实验：通过检测胃癌患者及健康对照者的血清样本，验证潜在生物标志物的临床诊断价值。同时，通过体外细胞实验，探究这些标志物在胃癌细胞中的表达水平及功能。

研究结论

研究成果

1. 候选生物标志物筛选：研究共筛选出四个候选生物标志物：ILF2、PGM2L1、CHD7和JCHAIN。它们在肿瘤与正常组织间的mRNA水平显著差异，并展现出不同的胃癌诊断性能。在TCGA和GEO数据集中，其诊断效能的受试者工作特征曲线下面积（AUROC）分别为0.629至0.950和0.736至0.840。

2. ILF2的突出表现：生物信息学分析显示，仅ILF2基因水平与免疫细胞浸润、某些检查点基因表达、化疗敏感性及免疫治疗反应相关联。血清检测结果显示，胃癌患者ILF2水平显著高于对照组，其诊断胃癌的AUROC高达0.944，并且在胃癌细胞培养上清液中亦能检测到ILF2。这表明ILF2具有出色的诊断性能及可能的肿瘤分泌特性。

研究意义

1. 跨组学策略有效性：本研究证实，整合蛋白质组学与转录组学的跨组学分析是有效发现胃癌血清生物标志物的方法，为后续类似研究提供了有力的实证支持。

2. ILF2作为诊断标志物与治疗靶点：ILF2被确认为一种潜在的胃癌诊断生物标志物，其高诊断效能有望提升胃癌的早期筛查准确性。此外，ILF2在胃癌细胞中的功能研究表明，敲低ILF2可显著抑制细胞增殖与克隆形成，而过表达ILF2则促进这些恶性行为。这些结果提示ILF2不仅具有诊断价值，还可能是胃癌治疗的潜在靶点。

综上所述，本研究通过跨组学分析发现了ILF2这一具有临床诊断价值的胃癌血清生物标志物，并初步揭示其在胃癌细胞中的功能作用，为进一步开发胃癌的早期诊断工具和新型治疗策略提供了重要线索。这对于改善胃癌患者的早期诊断率和预后具有重要意义。

资讯来源：https://bmccancer.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12885-024-12175-z

资讯发布时间：2024-04-15

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